Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CENPFP49454 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CENPFP49454 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CENPFP49454 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CENPFP49454 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CENPFP49454 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CENPFP49454 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CENPFP49454 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CENPFP49454 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CENPFP49454 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CENPFP49454 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CENPFP49454 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CENPFP49454 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CENPFP49454 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CENPFP49454 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CENPFP49454 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CENPFP49454 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CENPFP49454 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CENPFP49454 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CENPFP49454 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CENPFP49454 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CENPFP49454 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CENPFP49454 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CENPFP49454 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CENPFP49454 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CENPFP49454 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CENPFP49454 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CENPFP49454 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CENPFP49454 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CENPFP49454 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CENPFP49454 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CENPFP49454 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CENPFP49454 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CENPFP49454 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CENPFP49454 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CENPFP49454 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CENPFP49454 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CENPFP49454 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CENPFP49454 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CENPFP49454 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CENPFP49454 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CENPFP49454 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CENPFP49454 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CENPFP49454 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CENPFP49454 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CENPFP49454 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CENPFP49454 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CENPFP49454 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CENPFP49454 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CENPFP49454 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CENPFP49454 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CENPFP49454 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CENPFP49454 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CENPFP49454 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CENPFP49454 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CENPFP49454 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CENPFP49454 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CENPFP49454 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CENPFP49454 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CENPFP49454 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CENPFP49454 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CENPFP49454 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CENPFP49454 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CENPFP49454 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CENPFP49454 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CENPFP49454 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CENPFP49454 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CENPFP49454 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CENPFP49454 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CENPFP49454 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CENPFP49454 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CENPFP49454 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CENPFP49454 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CENPFP49454 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CENPFP49454 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CENPFP49454 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CENPFP49454 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CENPFP49454 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
CENPFP49454 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
CENPFP49454 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CENPFP49454 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CENPFP49454 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CENPFP49454 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CENPFP49454 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CENPFP49454 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CENPFP49454 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CENPFP49454 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CENPFP49454 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CENPFP49454 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CENPFP49454 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CENPFP49454 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CENPFP49454 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CENPFP49454 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CENPFP49454 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CENPFP49454 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CENPFP49454 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CENPFP49454 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CENPFP49454 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CENPFP49454 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CENPFP49454 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms