Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACTN2P35609 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACTN2P35609 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACTN2P35609 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACTN2P35609 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACTN2P35609 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACTN2P35609 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACTN2P35609 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACTN2P35609 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACTN2P35609 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACTN2P35609 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACTN2P35609 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACTN2P35609 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACTN2P35609 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ACTN2P35609 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACTN2P35609 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACTN2P35609 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ACTN2P35609 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ACTN2P35609 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ACTN2P35609 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ACTN2P35609 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ACTN2P35609 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ACTN2P35609 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ACTN2P35609 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ACTN2P35609 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ACTN2P35609 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACTN2P35609 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACTN2P35609 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACTN2P35609 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACTN2P35609 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACTN2P35609 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACTN2P35609 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACTN2P35609 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ACTN2P35609 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ACTN2P35609 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ACTN2P35609 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ACTN2P35609 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ACTN2P35609 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ACTN2P35609 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ACTN2P35609 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ACTN2P35609 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACTN2P35609 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACTN2P35609 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACTN2P35609 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACTN2P35609 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACTN2P35609 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACTN2P35609 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACTN2P35609 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACTN2P35609 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACTN2P35609 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACTN2P35609 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACTN2P35609 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACTN2P35609 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACTN2P35609 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACTN2P35609 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACTN2P35609 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACTN2P35609 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACTN2P35609 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACTN2P35609 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACTN2P35609 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACTN2P35609 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACTN2P35609 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACTN2P35609 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACTN2P35609 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACTN2P35609 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACTN2P35609 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACTN2P35609 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACTN2P35609 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACTN2P35609 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACTN2P35609 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACTN2P35609 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACTN2P35609 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ACTN2P35609 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACTN2P35609 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACTN2P35609 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACTN2P35609 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACTN2P35609 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACTN2P35609 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACTN2P35609 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACTN2P35609 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACTN2P35609 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACTN2P35609 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ACTN2P35609 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACTN2P35609 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ACTN2P35609 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ACTN2P35609 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACTN2P35609 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACTN2P35609 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACTN2P35609 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACTN2P35609 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACTN2P35609 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACTN2P35609 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACTN2P35609 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACTN2P35609 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACTN2P35609 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACTN2P35609 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACTN2P35609 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACTN2P35609 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACTN2P35609 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ACTN2P35609 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms