Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD40LGP29965 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD40LGP29965 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD40LGP29965 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CD40LGP29965 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD40LGP29965 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD40LGP29965 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD40LGP29965 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD40LGP29965 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CD40LGP29965 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CD40LGP29965 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CD40LGP29965 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CD40LGP29965 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CD40LGP29965 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CD40LGP29965 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CD40LGP29965 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CD40LGP29965 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CD40LGP29965 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CD40LGP29965 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CD40LGP29965 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CD40LGP29965 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CD40LGP29965 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CD40LGP29965 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CD40LGP29965 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CD40LGP29965 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CD40LGP29965 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CD40LGP29965 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CD40LGP29965 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CD40LGP29965 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CD40LGP29965 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CD40LGP29965 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CD40LGP29965 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CD40LGP29965 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CD40LGP29965 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CD40LGP29965 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CD40LGP29965 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CD40LGP29965 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CD40LGP29965 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CD40LGP29965 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CD40LGP29965 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CD40LGP29965 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CD40LGP29965 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CD40LGP29965 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CD40LGP29965 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CD40LGP29965 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CD40LGP29965 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CD40LGP29965 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CD40LGP29965 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CD40LGP29965 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CD40LGP29965 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CD40LGP29965 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CD40LGP29965 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CD40LGP29965 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CD40LGP29965 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CD40LGP29965 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CD40LGP29965 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CD40LGP29965 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CD40LGP29965 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CD40LGP29965 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CD40LGP29965 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CD40LGP29965 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CD40LGP29965 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CD40LGP29965 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CD40LGP29965 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CD40LGP29965 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CD40LGP29965 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CD40LGP29965 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CD40LGP29965 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CD40LGP29965 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CD40LGP29965 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CD40LGP29965 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CD40LGP29965 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CD40LGP29965 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CD40LGP29965 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CD40LGP29965 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CD40LGP29965 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CD40LGP29965 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CD40LGP29965 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CD40LGP29965 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CD40LGP29965 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CD40LGP29965 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CD40LGP29965 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CD40LGP29965 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CD40LGP29965 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CD40LGP29965 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CD40LGP29965 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CD40LGP29965 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CD40LGP29965 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CD40LGP29965 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CD40LGP29965 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CD40LGP29965 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CD40LGP29965 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CD40LGP29965 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CD40LGP29965 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CD40LGP29965 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CD40LGP29965 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CD40LGP29965 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CD40LGP29965 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CD40LGP29965 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CD40LGP29965 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms