Protein–RNA interactions for Protein: P28289

TMOD1, Tropomodulin-1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1P28289 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMOD1P28289 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMOD1P28289 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMOD1P28289 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMOD1P28289 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMOD1P28289 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMOD1P28289 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TMOD1P28289 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMOD1P28289 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TMOD1P28289 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMOD1P28289 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMOD1P28289 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMOD1P28289 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TMOD1P28289 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMOD1P28289 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMOD1P28289 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMOD1P28289 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMOD1P28289 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMOD1P28289 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMOD1P28289 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMOD1P28289 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TMOD1P28289 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMOD1P28289 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMOD1P28289 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMOD1P28289 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMOD1P28289 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMOD1P28289 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMOD1P28289 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMOD1P28289 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMOD1P28289 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMOD1P28289 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMOD1P28289 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMOD1P28289 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMOD1P28289 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMOD1P28289 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMOD1P28289 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMOD1P28289 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMOD1P28289 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMOD1P28289 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMOD1P28289 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMOD1P28289 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMOD1P28289 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMOD1P28289 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMOD1P28289 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMOD1P28289 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMOD1P28289 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMOD1P28289 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMOD1P28289 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMOD1P28289 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMOD1P28289 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMOD1P28289 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMOD1P28289 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMOD1P28289 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMOD1P28289 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMOD1P28289 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMOD1P28289 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMOD1P28289 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMOD1P28289 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMOD1P28289 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMOD1P28289 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMOD1P28289 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMOD1P28289 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMOD1P28289 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMOD1P28289 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMOD1P28289 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMOD1P28289 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMOD1P28289 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMOD1P28289 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMOD1P28289 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMOD1P28289 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMOD1P28289 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMOD1P28289 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TMOD1P28289 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMOD1P28289 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMOD1P28289 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMOD1P28289 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMOD1P28289 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMOD1P28289 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMOD1P28289 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMOD1P28289 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TMOD1P28289 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMOD1P28289 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMOD1P28289 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMOD1P28289 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMOD1P28289 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMOD1P28289 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMOD1P28289 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMOD1P28289 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMOD1P28289 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMOD1P28289 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMOD1P28289 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMOD1P28289 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMOD1P28289 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMOD1P28289 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMOD1P28289 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMOD1P28289 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMOD1P28289 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMOD1P28289 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMOD1P28289 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMOD1P28289 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms