Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTSSP25774 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CTSSP25774 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTSSP25774 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTSSP25774 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTSSP25774 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTSSP25774 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTSSP25774 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTSSP25774 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTSSP25774 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTSSP25774 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTSSP25774 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTSSP25774 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTSSP25774 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTSSP25774 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTSSP25774 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTSSP25774 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTSSP25774 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTSSP25774 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTSSP25774 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTSSP25774 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTSSP25774 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTSSP25774 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTSSP25774 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTSSP25774 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTSSP25774 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTSSP25774 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTSSP25774 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTSSP25774 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTSSP25774 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTSSP25774 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTSSP25774 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTSSP25774 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTSSP25774 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTSSP25774 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTSSP25774 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTSSP25774 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTSSP25774 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTSSP25774 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTSSP25774 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTSSP25774 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CTSSP25774 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTSSP25774 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTSSP25774 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTSSP25774 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTSSP25774 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTSSP25774 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTSSP25774 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CTSSP25774 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTSSP25774 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTSSP25774 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTSSP25774 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTSSP25774 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTSSP25774 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CTSSP25774 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CTSSP25774 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTSSP25774 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTSSP25774 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTSSP25774 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTSSP25774 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTSSP25774 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTSSP25774 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTSSP25774 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTSSP25774 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTSSP25774 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTSSP25774 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTSSP25774 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTSSP25774 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTSSP25774 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTSSP25774 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTSSP25774 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTSSP25774 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTSSP25774 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTSSP25774 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTSSP25774 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTSSP25774 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTSSP25774 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTSSP25774 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTSSP25774 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTSSP25774 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTSSP25774 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTSSP25774 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTSSP25774 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTSSP25774 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTSSP25774 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTSSP25774 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTSSP25774 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTSSP25774 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTSSP25774 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTSSP25774 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTSSP25774 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTSSP25774 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTSSP25774 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CTSSP25774 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CTSSP25774 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CTSSP25774 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CTSSP25774 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CTSSP25774 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CTSSP25774 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CTSSP25774 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms