Protein–RNA interactions for Protein: P24385

CCND1, G1/S-specific cyclin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND1P24385 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCND1P24385 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCND1P24385 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCND1P24385 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCND1P24385 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCND1P24385 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCND1P24385 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCND1P24385 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CCND1P24385 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCND1P24385 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CCND1P24385 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CCND1P24385 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCND1P24385 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCND1P24385 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCND1P24385 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCND1P24385 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCND1P24385 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCND1P24385 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCND1P24385 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCND1P24385 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCND1P24385 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCND1P24385 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCND1P24385 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCND1P24385 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCND1P24385 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCND1P24385 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCND1P24385 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCND1P24385 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCND1P24385 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCND1P24385 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CCND1P24385 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCND1P24385 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCND1P24385 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCND1P24385 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCND1P24385 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCND1P24385 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCND1P24385 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCND1P24385 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCND1P24385 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CCND1P24385 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCND1P24385 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCND1P24385 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCND1P24385 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCND1P24385 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCND1P24385 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCND1P24385 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCND1P24385 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCND1P24385 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCND1P24385 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCND1P24385 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCND1P24385 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCND1P24385 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCND1P24385 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCND1P24385 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCND1P24385 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CCND1P24385 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCND1P24385 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCND1P24385 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCND1P24385 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCND1P24385 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCND1P24385 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCND1P24385 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCND1P24385 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCND1P24385 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCND1P24385 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCND1P24385 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCND1P24385 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCND1P24385 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCND1P24385 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCND1P24385 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCND1P24385 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCND1P24385 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCND1P24385 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCND1P24385 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCND1P24385 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCND1P24385 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCND1P24385 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCND1P24385 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCND1P24385 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCND1P24385 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCND1P24385 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCND1P24385 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCND1P24385 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCND1P24385 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCND1P24385 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCND1P24385 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCND1P24385 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCND1P24385 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCND1P24385 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCND1P24385 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCND1P24385 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCND1P24385 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCND1P24385 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCND1P24385 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCND1P24385 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCND1P24385 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCND1P24385 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCND1P24385 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCND1P24385 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCND1P24385 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 313 ms