Protein–RNA interactions for Protein: P17612

PRKACA, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACAP17612 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRKACAP17612 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PRKACAP17612 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PRKACAP17612 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRKACAP17612 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRKACAP17612 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRKACAP17612 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRKACAP17612 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRKACAP17612 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRKACAP17612 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRKACAP17612 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRKACAP17612 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRKACAP17612 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRKACAP17612 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRKACAP17612 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRKACAP17612 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRKACAP17612 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRKACAP17612 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRKACAP17612 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRKACAP17612 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRKACAP17612 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRKACAP17612 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRKACAP17612 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRKACAP17612 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRKACAP17612 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRKACAP17612 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRKACAP17612 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRKACAP17612 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRKACAP17612 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRKACAP17612 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRKACAP17612 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRKACAP17612 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRKACAP17612 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRKACAP17612 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRKACAP17612 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRKACAP17612 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRKACAP17612 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRKACAP17612 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRKACAP17612 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRKACAP17612 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRKACAP17612 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRKACAP17612 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKACAP17612 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKACAP17612 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKACAP17612 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKACAP17612 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKACAP17612 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKACAP17612 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKACAP17612 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKACAP17612 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKACAP17612 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKACAP17612 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKACAP17612 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKACAP17612 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKACAP17612 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKACAP17612 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKACAP17612 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKACAP17612 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKACAP17612 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKACAP17612 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKACAP17612 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKACAP17612 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKACAP17612 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKACAP17612 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKACAP17612 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRKACAP17612 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRKACAP17612 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRKACAP17612 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRKACAP17612 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRKACAP17612 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRKACAP17612 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRKACAP17612 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRKACAP17612 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRKACAP17612 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRKACAP17612 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRKACAP17612 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRKACAP17612 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRKACAP17612 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRKACAP17612 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRKACAP17612 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PRKACAP17612 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRKACAP17612 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRKACAP17612 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRKACAP17612 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRKACAP17612 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRKACAP17612 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRKACAP17612 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRKACAP17612 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRKACAP17612 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRKACAP17612 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRKACAP17612 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRKACAP17612 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRKACAP17612 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRKACAP17612 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRKACAP17612 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRKACAP17612 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PRKACAP17612 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRKACAP17612 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRKACAP17612 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRKACAP17612 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms