Protein–RNA interactions for Protein: P16871

IL7R, Interleukin-7 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL7RP16871 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IL7RP16871 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IL7RP16871 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IL7RP16871 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IL7RP16871 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IL7RP16871 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IL7RP16871 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IL7RP16871 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IL7RP16871 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
IL7RP16871 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IL7RP16871 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IL7RP16871 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IL7RP16871 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IL7RP16871 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IL7RP16871 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IL7RP16871 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IL7RP16871 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IL7RP16871 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IL7RP16871 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IL7RP16871 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IL7RP16871 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IL7RP16871 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IL7RP16871 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IL7RP16871 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IL7RP16871 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IL7RP16871 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IL7RP16871 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IL7RP16871 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IL7RP16871 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IL7RP16871 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IL7RP16871 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IL7RP16871 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IL7RP16871 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IL7RP16871 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IL7RP16871 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IL7RP16871 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IL7RP16871 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IL7RP16871 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IL7RP16871 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IL7RP16871 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IL7RP16871 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IL7RP16871 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IL7RP16871 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IL7RP16871 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IL7RP16871 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
IL7RP16871 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IL7RP16871 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IL7RP16871 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IL7RP16871 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IL7RP16871 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IL7RP16871 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IL7RP16871 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IL7RP16871 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IL7RP16871 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IL7RP16871 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IL7RP16871 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IL7RP16871 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IL7RP16871 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IL7RP16871 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IL7RP16871 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
IL7RP16871 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IL7RP16871 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IL7RP16871 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IL7RP16871 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IL7RP16871 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IL7RP16871 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
IL7RP16871 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IL7RP16871 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IL7RP16871 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IL7RP16871 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IL7RP16871 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IL7RP16871 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IL7RP16871 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IL7RP16871 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IL7RP16871 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IL7RP16871 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IL7RP16871 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IL7RP16871 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IL7RP16871 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IL7RP16871 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IL7RP16871 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IL7RP16871 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IL7RP16871 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IL7RP16871 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IL7RP16871 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IL7RP16871 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IL7RP16871 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IL7RP16871 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IL7RP16871 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IL7RP16871 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IL7RP16871 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IL7RP16871 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IL7RP16871 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IL7RP16871 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IL7RP16871 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IL7RP16871 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IL7RP16871 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IL7RP16871 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IL7RP16871 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IL7RP16871 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms