Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNNT1P13805 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNNT1P13805 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNNT1P13805 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNNT1P13805 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNNT1P13805 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNNT1P13805 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TNNT1P13805 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNNT1P13805 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNNT1P13805 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNNT1P13805 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNNT1P13805 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
TNNT1P13805 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNNT1P13805 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNNT1P13805 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNNT1P13805 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNNT1P13805 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNNT1P13805 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNNT1P13805 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TNNT1P13805 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
TNNT1P13805 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TNNT1P13805 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TNNT1P13805 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TNNT1P13805 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TNNT1P13805 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TNNT1P13805 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TNNT1P13805 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNNT1P13805 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNNT1P13805 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNNT1P13805 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNNT1P13805 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNNT1P13805 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNNT1P13805 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNNT1P13805 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNNT1P13805 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNT1P13805 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNT1P13805 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNT1P13805 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNT1P13805 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNT1P13805 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNT1P13805 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNT1P13805 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNT1P13805 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNT1P13805 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNT1P13805 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNT1P13805 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNNT1P13805 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNNT1P13805 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNNT1P13805 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNNT1P13805 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNNT1P13805 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNNT1P13805 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNNT1P13805 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNNT1P13805 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNNT1P13805 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNNT1P13805 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNNT1P13805 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNNT1P13805 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNNT1P13805 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TNNT1P13805 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TNNT1P13805 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TNNT1P13805 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TNNT1P13805 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TNNT1P13805 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TNNT1P13805 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TNNT1P13805 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TNNT1P13805 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TNNT1P13805 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TNNT1P13805 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TNNT1P13805 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TNNT1P13805 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TNNT1P13805 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TNNT1P13805 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TNNT1P13805 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNNT1P13805 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNNT1P13805 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNNT1P13805 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNNT1P13805 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNNT1P13805 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNNT1P13805 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNNT1P13805 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNNT1P13805 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNNT1P13805 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNNT1P13805 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNNT1P13805 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNNT1P13805 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNNT1P13805 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNNT1P13805 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNNT1P13805 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNNT1P13805 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNNT1P13805 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNNT1P13805 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNNT1P13805 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNNT1P13805 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNNT1P13805 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNNT1P13805 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNNT1P13805 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNNT1P13805 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TNNT1P13805 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNNT1P13805 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms