Protein–RNA interactions for Protein: P12107

COL11A1, Collagen alpha-1(XI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL11A1P12107 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
COL11A1P12107 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
COL11A1P12107 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
COL11A1P12107 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
COL11A1P12107 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
COL11A1P12107 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
COL11A1P12107 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
COL11A1P12107 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
COL11A1P12107 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
COL11A1P12107 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
COL11A1P12107 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
COL11A1P12107 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
COL11A1P12107 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
COL11A1P12107 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
COL11A1P12107 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
COL11A1P12107 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
COL11A1P12107 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
COL11A1P12107 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
COL11A1P12107 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
COL11A1P12107 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
COL11A1P12107 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
COL11A1P12107 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
COL11A1P12107 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
COL11A1P12107 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
COL11A1P12107 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
COL11A1P12107 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
COL11A1P12107 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
COL11A1P12107 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
COL11A1P12107 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
COL11A1P12107 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
COL11A1P12107 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
COL11A1P12107 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
COL11A1P12107 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
COL11A1P12107 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
COL11A1P12107 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
COL11A1P12107 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
COL11A1P12107 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
COL11A1P12107 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
COL11A1P12107 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
COL11A1P12107 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
COL11A1P12107 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
COL11A1P12107 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
COL11A1P12107 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
COL11A1P12107 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
COL11A1P12107 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
COL11A1P12107 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
COL11A1P12107 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
COL11A1P12107 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
COL11A1P12107 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
COL11A1P12107 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
COL11A1P12107 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
COL11A1P12107 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
COL11A1P12107 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
COL11A1P12107 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
COL11A1P12107 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
COL11A1P12107 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
COL11A1P12107 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
COL11A1P12107 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
COL11A1P12107 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
COL11A1P12107 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
COL11A1P12107 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
COL11A1P12107 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.55■■■□□ 2
COL11A1P12107 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
COL11A1P12107 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
COL11A1P12107 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
COL11A1P12107 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
COL11A1P12107 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
COL11A1P12107 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
COL11A1P12107 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
COL11A1P12107 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
COL11A1P12107 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
COL11A1P12107 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.53■■■□□ 2
COL11A1P12107 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
COL11A1P12107 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
COL11A1P12107 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
COL11A1P12107 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
COL11A1P12107 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
COL11A1P12107 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
COL11A1P12107 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
COL11A1P12107 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
COL11A1P12107 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
COL11A1P12107 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
COL11A1P12107 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.52■■■□□ 2
COL11A1P12107 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
COL11A1P12107 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
COL11A1P12107 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.51■■■□□ 2
COL11A1P12107 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
COL11A1P12107 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
COL11A1P12107 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
COL11A1P12107 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
COL11A1P12107 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
COL11A1P12107 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
COL11A1P12107 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
COL11A1P12107 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
COL11A1P12107 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
COL11A1P12107 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
COL11A1P12107 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
COL11A1P12107 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
COL11A1P12107 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
COL11A1P12107 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms