Protein–RNA interactions for Protein: P05556

ITGB1, Integrin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB1P05556 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ITGB1P05556 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ITGB1P05556 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ITGB1P05556 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ITGB1P05556 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ITGB1P05556 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ITGB1P05556 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGB1P05556 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGB1P05556 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGB1P05556 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGB1P05556 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGB1P05556 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGB1P05556 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGB1P05556 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGB1P05556 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGB1P05556 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ITGB1P05556 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ITGB1P05556 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ITGB1P05556 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ITGB1P05556 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ITGB1P05556 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGB1P05556 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGB1P05556 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGB1P05556 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGB1P05556 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGB1P05556 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGB1P05556 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGB1P05556 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGB1P05556 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGB1P05556 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGB1P05556 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGB1P05556 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGB1P05556 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGB1P05556 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGB1P05556 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGB1P05556 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGB1P05556 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGB1P05556 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGB1P05556 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGB1P05556 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGB1P05556 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGB1P05556 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGB1P05556 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGB1P05556 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGB1P05556 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGB1P05556 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGB1P05556 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGB1P05556 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGB1P05556 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGB1P05556 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGB1P05556 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGB1P05556 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGB1P05556 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGB1P05556 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGB1P05556 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGB1P05556 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGB1P05556 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGB1P05556 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGB1P05556 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGB1P05556 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGB1P05556 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGB1P05556 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGB1P05556 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGB1P05556 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGB1P05556 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGB1P05556 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGB1P05556 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGB1P05556 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGB1P05556 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGB1P05556 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGB1P05556 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGB1P05556 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGB1P05556 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGB1P05556 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGB1P05556 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGB1P05556 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGB1P05556 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGB1P05556 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGB1P05556 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGB1P05556 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGB1P05556 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGB1P05556 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGB1P05556 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGB1P05556 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGB1P05556 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGB1P05556 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGB1P05556 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGB1P05556 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGB1P05556 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGB1P05556 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGB1P05556 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGB1P05556 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGB1P05556 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGB1P05556 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGB1P05556 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGB1P05556 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGB1P05556 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGB1P05556 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGB1P05556 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGB1P05556 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms