Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABARAPO95166 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABARAPO95166 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABARAPO95166 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABARAPO95166 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABARAPO95166 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABARAPO95166 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABARAPO95166 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABARAPO95166 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABARAPO95166 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABARAPO95166 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABARAPO95166 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABARAPO95166 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABARAPO95166 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABARAPO95166 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABARAPO95166 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABARAPO95166 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GABARAPO95166 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GABARAPO95166 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GABARAPO95166 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GABARAPO95166 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
GABARAPO95166 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GABARAPO95166 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GABARAPO95166 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GABARAPO95166 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GABARAPO95166 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GABARAPO95166 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GABARAPO95166 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GABARAPO95166 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GABARAPO95166 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GABARAPO95166 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GABARAPO95166 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GABARAPO95166 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GABARAPO95166 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GABARAPO95166 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GABARAPO95166 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GABARAPO95166 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GABARAPO95166 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GABARAPO95166 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GABARAPO95166 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GABARAPO95166 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GABARAPO95166 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GABARAPO95166 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GABARAPO95166 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GABARAPO95166 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GABARAPO95166 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GABARAPO95166 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GABARAPO95166 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GABARAPO95166 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GABARAPO95166 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GABARAPO95166 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GABARAPO95166 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GABARAPO95166 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GABARAPO95166 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GABARAPO95166 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GABARAPO95166 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GABARAPO95166 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GABARAPO95166 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GABARAPO95166 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GABARAPO95166 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABARAPO95166 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABARAPO95166 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABARAPO95166 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABARAPO95166 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABARAPO95166 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABARAPO95166 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABARAPO95166 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABARAPO95166 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABARAPO95166 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GABARAPO95166 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABARAPO95166 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABARAPO95166 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABARAPO95166 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABARAPO95166 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABARAPO95166 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABARAPO95166 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABARAPO95166 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABARAPO95166 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABARAPO95166 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABARAPO95166 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABARAPO95166 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GABARAPO95166 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABARAPO95166 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABARAPO95166 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABARAPO95166 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABARAPO95166 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABARAPO95166 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABARAPO95166 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABARAPO95166 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABARAPO95166 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABARAPO95166 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABARAPO95166 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABARAPO95166 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GABARAPO95166 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABARAPO95166 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABARAPO95166 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABARAPO95166 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABARAPO95166 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABARAPO95166 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABARAPO95166 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 760.4 ms