Protein–RNA interactions for Protein: O75712

GJB3, Gap junction beta-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB3O75712 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJB3O75712 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJB3O75712 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJB3O75712 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJB3O75712 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJB3O75712 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJB3O75712 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJB3O75712 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJB3O75712 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJB3O75712 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJB3O75712 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GJB3O75712 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJB3O75712 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJB3O75712 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJB3O75712 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJB3O75712 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJB3O75712 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJB3O75712 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJB3O75712 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GJB3O75712 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJB3O75712 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJB3O75712 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GJB3O75712 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GJB3O75712 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GJB3O75712 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GJB3O75712 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GJB3O75712 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
GJB3O75712 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GJB3O75712 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GJB3O75712 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJB3O75712 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJB3O75712 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJB3O75712 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJB3O75712 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJB3O75712 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJB3O75712 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJB3O75712 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJB3O75712 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJB3O75712 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJB3O75712 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJB3O75712 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJB3O75712 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJB3O75712 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJB3O75712 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJB3O75712 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GJB3O75712 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GJB3O75712 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJB3O75712 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GJB3O75712 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJB3O75712 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJB3O75712 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJB3O75712 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJB3O75712 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GJB3O75712 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJB3O75712 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GJB3O75712 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJB3O75712 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJB3O75712 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJB3O75712 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJB3O75712 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GJB3O75712 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJB3O75712 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJB3O75712 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJB3O75712 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GJB3O75712 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GJB3O75712 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GJB3O75712 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GJB3O75712 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GJB3O75712 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GJB3O75712 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJB3O75712 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJB3O75712 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJB3O75712 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJB3O75712 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJB3O75712 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJB3O75712 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJB3O75712 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJB3O75712 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJB3O75712 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJB3O75712 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJB3O75712 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GJB3O75712 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJB3O75712 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJB3O75712 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJB3O75712 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJB3O75712 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJB3O75712 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJB3O75712 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJB3O75712 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GJB3O75712 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJB3O75712 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJB3O75712 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJB3O75712 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJB3O75712 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJB3O75712 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJB3O75712 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJB3O75712 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJB3O75712 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GJB3O75712 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJB3O75712 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms