Protein–RNA interactions for Protein: O60683

PEX10, Peroxisome biogenesis factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX10O60683 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PEX10O60683 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PEX10O60683 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PEX10O60683 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PEX10O60683 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PEX10O60683 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PEX10O60683 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PEX10O60683 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PEX10O60683 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PEX10O60683 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PEX10O60683 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PEX10O60683 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PEX10O60683 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PEX10O60683 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PEX10O60683 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PEX10O60683 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PEX10O60683 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PEX10O60683 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PEX10O60683 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PEX10O60683 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PEX10O60683 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PEX10O60683 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PEX10O60683 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PEX10O60683 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PEX10O60683 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PEX10O60683 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PEX10O60683 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PEX10O60683 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PEX10O60683 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PEX10O60683 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PEX10O60683 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PEX10O60683 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PEX10O60683 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PEX10O60683 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PEX10O60683 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PEX10O60683 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PEX10O60683 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PEX10O60683 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PEX10O60683 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PEX10O60683 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PEX10O60683 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PEX10O60683 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PEX10O60683 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PEX10O60683 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PEX10O60683 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PEX10O60683 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PEX10O60683 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PEX10O60683 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PEX10O60683 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PEX10O60683 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PEX10O60683 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PEX10O60683 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PEX10O60683 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PEX10O60683 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PEX10O60683 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PEX10O60683 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PEX10O60683 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PEX10O60683 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PEX10O60683 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PEX10O60683 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PEX10O60683 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PEX10O60683 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PEX10O60683 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PEX10O60683 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PEX10O60683 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PEX10O60683 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PEX10O60683 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PEX10O60683 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PEX10O60683 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PEX10O60683 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PEX10O60683 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PEX10O60683 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PEX10O60683 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PEX10O60683 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PEX10O60683 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PEX10O60683 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PEX10O60683 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
PEX10O60683 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PEX10O60683 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PEX10O60683 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PEX10O60683 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PEX10O60683 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PEX10O60683 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PEX10O60683 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PEX10O60683 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PEX10O60683 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PEX10O60683 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
PEX10O60683 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PEX10O60683 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PEX10O60683 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PEX10O60683 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PEX10O60683 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PEX10O60683 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PEX10O60683 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PEX10O60683 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PEX10O60683 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PEX10O60683 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PEX10O60683 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PEX10O60683 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PEX10O60683 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 160.5 ms