Protein–RNA interactions for Protein: O43772

SLC25A20, Mitochondrial carnitine/acylcarnitine carrier protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A20O43772 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC25A20O43772 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC25A20O43772 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC25A20O43772 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC25A20O43772 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC25A20O43772 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC25A20O43772 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC25A20O43772 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC25A20O43772 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC25A20O43772 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC25A20O43772 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC25A20O43772 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC25A20O43772 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC25A20O43772 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC25A20O43772 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC25A20O43772 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC25A20O43772 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC25A20O43772 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC25A20O43772 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC25A20O43772 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC25A20O43772 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC25A20O43772 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC25A20O43772 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC25A20O43772 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC25A20O43772 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC25A20O43772 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC25A20O43772 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC25A20O43772 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC25A20O43772 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC25A20O43772 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC25A20O43772 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC25A20O43772 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC25A20O43772 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC25A20O43772 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC25A20O43772 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC25A20O43772 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC25A20O43772 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC25A20O43772 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC25A20O43772 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC25A20O43772 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC25A20O43772 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC25A20O43772 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC25A20O43772 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC25A20O43772 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC25A20O43772 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC25A20O43772 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC25A20O43772 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC25A20O43772 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC25A20O43772 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC25A20O43772 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC25A20O43772 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A20O43772 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A20O43772 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A20O43772 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A20O43772 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A20O43772 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A20O43772 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A20O43772 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A20O43772 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC25A20O43772 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC25A20O43772 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC25A20O43772 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC25A20O43772 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC25A20O43772 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC25A20O43772 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC25A20O43772 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC25A20O43772 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC25A20O43772 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC25A20O43772 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC25A20O43772 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC25A20O43772 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC25A20O43772 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC25A20O43772 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC25A20O43772 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC25A20O43772 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC25A20O43772 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC25A20O43772 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC25A20O43772 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC25A20O43772 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC25A20O43772 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC25A20O43772 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC25A20O43772 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC25A20O43772 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC25A20O43772 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC25A20O43772 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC25A20O43772 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC25A20O43772 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC25A20O43772 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC25A20O43772 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC25A20O43772 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC25A20O43772 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC25A20O43772 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC25A20O43772 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC25A20O43772 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC25A20O43772 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC25A20O43772 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC25A20O43772 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC25A20O43772 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC25A20O43772 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC25A20O43772 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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