Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
VGFO15240 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
VGFO15240 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
VGFO15240 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
VGFO15240 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
VGFO15240 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
VGFO15240 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
VGFO15240 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
VGFO15240 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
VGFO15240 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
VGFO15240 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
VGFO15240 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
VGFO15240 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
VGFO15240 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
VGFO15240 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
VGFO15240 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC34.35■■■■□ 3.09
VGFO15240 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
VGFO15240 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
VGFO15240 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
VGFO15240 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
VGFO15240 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
VGFO15240 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
VGFO15240 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
VGFO15240 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
VGFO15240 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
VGFO15240 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
VGFO15240 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC34.31■■■■□ 3.08
VGFO15240 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
VGFO15240 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
VGFO15240 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
VGFO15240 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
VGFO15240 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
VGFO15240 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
VGFO15240 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
VGFO15240 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
VGFO15240 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
VGFO15240 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
VGFO15240 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
VGFO15240 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
VGFO15240 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
VGFO15240 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
VGFO15240 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
VGFO15240 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC34.27■■■■□ 3.08
VGFO15240 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
VGFO15240 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
VGFO15240 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
VGFO15240 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
VGFO15240 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
VGFO15240 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
VGFO15240 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
VGFO15240 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
VGFO15240 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
VGFO15240 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
VGFO15240 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
VGFO15240 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
VGFO15240 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
VGFO15240 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
VGFO15240 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
VGFO15240 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
VGFO15240 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
VGFO15240 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
VGFO15240 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
VGFO15240 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
VGFO15240 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
VGFO15240 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC34.2■■■■□ 3.07
VGFO15240 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
VGFO15240 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC34.2■■■■□ 3.07
VGFO15240 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
VGFO15240 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC34.2■■■■□ 3.07
VGFO15240 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
VGFO15240 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC34.19■■■■□ 3.06
VGFO15240 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
VGFO15240 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
VGFO15240 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
VGFO15240 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
VGFO15240 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
VGFO15240 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
VGFO15240 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
VGFO15240 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
VGFO15240 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
VGFO15240 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
VGFO15240 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
VGFO15240 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC34.17■■■■□ 3.06
VGFO15240 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
VGFO15240 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
VGFO15240 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
VGFO15240 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
VGFO15240 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
VGFO15240 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
VGFO15240 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
VGFO15240 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
VGFO15240 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
VGFO15240 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
VGFO15240 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
VGFO15240 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
VGFO15240 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
VGFO15240 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
VGFO15240 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
VGFO15240 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
VGFO15240 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.4 ms