Protein–RNA interactions for Protein: O15056

SYNJ2, Synaptojanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ2O15056 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC39.74■■■■□ 3.95
SYNJ2O15056 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC39.74■■■■□ 3.95
SYNJ2O15056 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
SYNJ2O15056 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
SYNJ2O15056 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC39.73■■■■□ 3.95
SYNJ2O15056 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
SYNJ2O15056 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC39.72■■■■□ 3.95
SYNJ2O15056 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
SYNJ2O15056 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC39.71■■■■□ 3.95
SYNJ2O15056 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
SYNJ2O15056 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
SYNJ2O15056 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC39.7■■■■□ 3.95
SYNJ2O15056 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
SYNJ2O15056 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC39.7■■■■□ 3.95
SYNJ2O15056 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
SYNJ2O15056 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
SYNJ2O15056 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
SYNJ2O15056 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC39.68■■■■□ 3.94
SYNJ2O15056 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC39.68■■■■□ 3.94
SYNJ2O15056 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.68■■■■□ 3.94
SYNJ2O15056 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
SYNJ2O15056 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC39.66■■■■□ 3.94
SYNJ2O15056 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC39.66■■■■□ 3.94
SYNJ2O15056 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
SYNJ2O15056 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
SYNJ2O15056 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC39.65■■■■□ 3.94
SYNJ2O15056 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.65■■■■□ 3.94
SYNJ2O15056 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
SYNJ2O15056 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC39.65■■■■□ 3.94
SYNJ2O15056 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC39.65■■■■□ 3.94
SYNJ2O15056 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC39.65■■■■□ 3.94
SYNJ2O15056 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC39.65■■■■□ 3.94
SYNJ2O15056 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
SYNJ2O15056 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC39.64■■■■□ 3.94
SYNJ2O15056 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC39.64■■■■□ 3.94
SYNJ2O15056 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC39.64■■■■□ 3.94
SYNJ2O15056 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC39.64■■■■□ 3.94
SYNJ2O15056 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
SYNJ2O15056 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
SYNJ2O15056 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC39.64■■■■□ 3.94
SYNJ2O15056 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC39.63■■■■□ 3.94
SYNJ2O15056 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
SYNJ2O15056 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC39.62■■■■□ 3.93
SYNJ2O15056 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC39.62■■■■□ 3.93
SYNJ2O15056 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC39.62■■■■□ 3.93
SYNJ2O15056 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC39.62■■■■□ 3.93
SYNJ2O15056 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.62■■■■□ 3.93
SYNJ2O15056 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
SYNJ2O15056 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC39.62■■■■□ 3.93
SYNJ2O15056 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
SYNJ2O15056 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC39.61■■■■□ 3.93
SYNJ2O15056 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC39.61■■■■□ 3.93
SYNJ2O15056 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
SYNJ2O15056 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
SYNJ2O15056 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
SYNJ2O15056 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.59■■■■□ 3.93
SYNJ2O15056 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC39.59■■■■□ 3.93
SYNJ2O15056 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.58■■■■□ 3.93
SYNJ2O15056 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC39.58■■■■□ 3.93
SYNJ2O15056 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
SYNJ2O15056 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
SYNJ2O15056 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC39.57■■■■□ 3.93
SYNJ2O15056 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC39.56■■■■□ 3.92
SYNJ2O15056 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
SYNJ2O15056 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
SYNJ2O15056 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
SYNJ2O15056 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC39.56■■■■□ 3.92
SYNJ2O15056 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
SYNJ2O15056 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
SYNJ2O15056 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC39.55■■■■□ 3.92
SYNJ2O15056 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
SYNJ2O15056 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC39.55■■■■□ 3.92
SYNJ2O15056 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.55■■■■□ 3.92
SYNJ2O15056 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC39.55■■■■□ 3.92
SYNJ2O15056 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.55■■■■□ 3.92
SYNJ2O15056 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC39.55■■■■□ 3.92
SYNJ2O15056 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC39.55■■■■□ 3.92
SYNJ2O15056 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
SYNJ2O15056 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
SYNJ2O15056 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.54■■■■□ 3.92
SYNJ2O15056 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC39.54■■■■□ 3.92
SYNJ2O15056 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC39.53■■■■□ 3.92
SYNJ2O15056 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC39.53■■■■□ 3.92
SYNJ2O15056 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
SYNJ2O15056 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.51■■■■□ 3.92
SYNJ2O15056 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC39.51■■■■□ 3.92
SYNJ2O15056 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
SYNJ2O15056 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC39.51■■■■□ 3.91
SYNJ2O15056 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
SYNJ2O15056 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.5■■■■□ 3.91
SYNJ2O15056 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
SYNJ2O15056 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
SYNJ2O15056 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.5■■■■□ 3.91
SYNJ2O15056 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC39.49■■■■□ 3.91
SYNJ2O15056 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC39.49■■■■□ 3.91
SYNJ2O15056 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
SYNJ2O15056 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
SYNJ2O15056 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
SYNJ2O15056 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
SYNJ2O15056 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms