Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
PTPRTO14522 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
PTPRTO14522 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC35.49■■■■□ 3.27
PTPRTO14522 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
PTPRTO14522 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
PTPRTO14522 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
PTPRTO14522 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
PTPRTO14522 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
PTPRTO14522 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
PTPRTO14522 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
PTPRTO14522 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
PTPRTO14522 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
PTPRTO14522 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
PTPRTO14522 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
PTPRTO14522 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
PTPRTO14522 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC35.45■■■■□ 3.27
PTPRTO14522 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC35.45■■■■□ 3.27
PTPRTO14522 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.26
PTPRTO14522 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
PTPRTO14522 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
PTPRTO14522 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
PTPRTO14522 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC35.44■■■■□ 3.26
PTPRTO14522 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
PTPRTO14522 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC35.44■■■■□ 3.26
PTPRTO14522 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
PTPRTO14522 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
PTPRTO14522 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
PTPRTO14522 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
PTPRTO14522 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
PTPRTO14522 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
PTPRTO14522 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
PTPRTO14522 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
PTPRTO14522 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
PTPRTO14522 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
PTPRTO14522 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
PTPRTO14522 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
PTPRTO14522 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
PTPRTO14522 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
PTPRTO14522 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
PTPRTO14522 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
PTPRTO14522 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
PTPRTO14522 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
PTPRTO14522 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
PTPRTO14522 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
PTPRTO14522 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
PTPRTO14522 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
PTPRTO14522 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
PTPRTO14522 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
PTPRTO14522 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.39■■■■□ 3.26
PTPRTO14522 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
PTPRTO14522 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
PTPRTO14522 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
PTPRTO14522 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
PTPRTO14522 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
PTPRTO14522 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
PTPRTO14522 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
PTPRTO14522 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
PTPRTO14522 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
PTPRTO14522 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
PTPRTO14522 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
PTPRTO14522 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
PTPRTO14522 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
PTPRTO14522 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
PTPRTO14522 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
PTPRTO14522 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
PTPRTO14522 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
PTPRTO14522 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
PTPRTO14522 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
PTPRTO14522 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
PTPRTO14522 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
PTPRTO14522 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
PTPRTO14522 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC35.34■■■■□ 3.25
PTPRTO14522 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
PTPRTO14522 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
PTPRTO14522 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
PTPRTO14522 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
PTPRTO14522 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
PTPRTO14522 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC35.32■■■■□ 3.25
PTPRTO14522 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
PTPRTO14522 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
PTPRTO14522 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
PTPRTO14522 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
PTPRTO14522 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
PTPRTO14522 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
PTPRTO14522 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
PTPRTO14522 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
PTPRTO14522 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
PTPRTO14522 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
PTPRTO14522 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC35.31■■■■□ 3.24
PTPRTO14522 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
PTPRTO14522 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
PTPRTO14522 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
PTPRTO14522 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
PTPRTO14522 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
PTPRTO14522 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
PTPRTO14522 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
PTPRTO14522 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
PTPRTO14522 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
PTPRTO14522 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
PTPRTO14522 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms