Protein–RNA interactions for Protein: O00308

WWP2, NEDD4-like E3 ubiquitin-protein ligase WWP2, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WWP2O00308 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
WWP2O00308 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
WWP2O00308 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
WWP2O00308 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
WWP2O00308 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
WWP2O00308 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
WWP2O00308 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
WWP2O00308 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
WWP2O00308 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
WWP2O00308 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
WWP2O00308 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WWP2O00308 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
WWP2O00308 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WWP2O00308 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
WWP2O00308 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WWP2O00308 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WWP2O00308 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WWP2O00308 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WWP2O00308 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
WWP2O00308 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
WWP2O00308 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WWP2O00308 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WWP2O00308 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WWP2O00308 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
WWP2O00308 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WWP2O00308 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WWP2O00308 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
WWP2O00308 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WWP2O00308 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
WWP2O00308 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
WWP2O00308 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
WWP2O00308 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
WWP2O00308 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
WWP2O00308 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
WWP2O00308 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
WWP2O00308 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
WWP2O00308 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
WWP2O00308 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
WWP2O00308 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
WWP2O00308 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
WWP2O00308 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
WWP2O00308 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
WWP2O00308 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WWP2O00308 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WWP2O00308 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WWP2O00308 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WWP2O00308 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
WWP2O00308 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WWP2O00308 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
WWP2O00308 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
WWP2O00308 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
WWP2O00308 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
WWP2O00308 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
WWP2O00308 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
WWP2O00308 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
WWP2O00308 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
WWP2O00308 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
WWP2O00308 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
WWP2O00308 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
WWP2O00308 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
WWP2O00308 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
WWP2O00308 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
WWP2O00308 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
WWP2O00308 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
WWP2O00308 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
WWP2O00308 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
WWP2O00308 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
WWP2O00308 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
WWP2O00308 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
WWP2O00308 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
WWP2O00308 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
WWP2O00308 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
WWP2O00308 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
WWP2O00308 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
WWP2O00308 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
WWP2O00308 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
WWP2O00308 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
WWP2O00308 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
WWP2O00308 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
WWP2O00308 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
WWP2O00308 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
WWP2O00308 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WWP2O00308 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WWP2O00308 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WWP2O00308 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WWP2O00308 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WWP2O00308 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WWP2O00308 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
WWP2O00308 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
WWP2O00308 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
WWP2O00308 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WWP2O00308 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
WWP2O00308 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
WWP2O00308 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
WWP2O00308 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
WWP2O00308 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
WWP2O00308 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
WWP2O00308 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
WWP2O00308 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
WWP2O00308 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms