Protein–RNA interactions for Protein: H3BSU7

TMX2-CTNND1, TMX2-CTNND1 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX2-CTNND1H3BSU7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMX2-CTNND1H3BSU7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMX2-CTNND1H3BSU7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMX2-CTNND1H3BSU7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMX2-CTNND1H3BSU7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMX2-CTNND1H3BSU7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMX2-CTNND1H3BSU7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMX2-CTNND1H3BSU7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMX2-CTNND1H3BSU7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMX2-CTNND1H3BSU7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMX2-CTNND1H3BSU7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMX2-CTNND1H3BSU7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMX2-CTNND1H3BSU7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMX2-CTNND1H3BSU7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TMX2-CTNND1H3BSU7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMX2-CTNND1H3BSU7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMX2-CTNND1H3BSU7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMX2-CTNND1H3BSU7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMX2-CTNND1H3BSU7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMX2-CTNND1H3BSU7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMX2-CTNND1H3BSU7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMX2-CTNND1H3BSU7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMX2-CTNND1H3BSU7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TMX2-CTNND1H3BSU7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMX2-CTNND1H3BSU7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMX2-CTNND1H3BSU7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMX2-CTNND1H3BSU7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMX2-CTNND1H3BSU7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMX2-CTNND1H3BSU7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMX2-CTNND1H3BSU7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TMX2-CTNND1H3BSU7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMX2-CTNND1H3BSU7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMX2-CTNND1H3BSU7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMX2-CTNND1H3BSU7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMX2-CTNND1H3BSU7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMX2-CTNND1H3BSU7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMX2-CTNND1H3BSU7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TMX2-CTNND1H3BSU7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMX2-CTNND1H3BSU7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMX2-CTNND1H3BSU7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMX2-CTNND1H3BSU7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMX2-CTNND1H3BSU7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMX2-CTNND1H3BSU7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMX2-CTNND1H3BSU7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMX2-CTNND1H3BSU7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMX2-CTNND1H3BSU7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMX2-CTNND1H3BSU7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMX2-CTNND1H3BSU7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMX2-CTNND1H3BSU7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMX2-CTNND1H3BSU7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMX2-CTNND1H3BSU7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMX2-CTNND1H3BSU7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMX2-CTNND1H3BSU7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TMX2-CTNND1H3BSU7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TMX2-CTNND1H3BSU7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMX2-CTNND1H3BSU7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMX2-CTNND1H3BSU7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMX2-CTNND1H3BSU7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMX2-CTNND1H3BSU7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMX2-CTNND1H3BSU7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMX2-CTNND1H3BSU7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMX2-CTNND1H3BSU7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMX2-CTNND1H3BSU7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TMX2-CTNND1H3BSU7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMX2-CTNND1H3BSU7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMX2-CTNND1H3BSU7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMX2-CTNND1H3BSU7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMX2-CTNND1H3BSU7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMX2-CTNND1H3BSU7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMX2-CTNND1H3BSU7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMX2-CTNND1H3BSU7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMX2-CTNND1H3BSU7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMX2-CTNND1H3BSU7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TMX2-CTNND1H3BSU7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMX2-CTNND1H3BSU7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMX2-CTNND1H3BSU7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMX2-CTNND1H3BSU7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms