Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLDN25C9JDP6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLDN25C9JDP6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLDN25C9JDP6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLDN25C9JDP6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLDN25C9JDP6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLDN25C9JDP6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLDN25C9JDP6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLDN25C9JDP6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLDN25C9JDP6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDN25C9JDP6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDN25C9JDP6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDN25C9JDP6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDN25C9JDP6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDN25C9JDP6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDN25C9JDP6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN25C9JDP6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN25C9JDP6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN25C9JDP6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN25C9JDP6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN25C9JDP6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN25C9JDP6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN25C9JDP6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN25C9JDP6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN25C9JDP6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN25C9JDP6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN25C9JDP6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN25C9JDP6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN25C9JDP6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN25C9JDP6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN25C9JDP6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN25C9JDP6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN25C9JDP6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN25C9JDP6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN25C9JDP6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN25C9JDP6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN25C9JDP6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN25C9JDP6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN25C9JDP6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN25C9JDP6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN25C9JDP6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN25C9JDP6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN25C9JDP6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN25C9JDP6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN25C9JDP6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN25C9JDP6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN25C9JDP6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLDN25C9JDP6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN25C9JDP6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN25C9JDP6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN25C9JDP6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN25C9JDP6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN25C9JDP6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN25C9JDP6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN25C9JDP6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN25C9JDP6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN25C9JDP6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN25C9JDP6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN25C9JDP6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN25C9JDP6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN25C9JDP6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN25C9JDP6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN25C9JDP6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN25C9JDP6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN25C9JDP6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN25C9JDP6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN25C9JDP6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN25C9JDP6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN25C9JDP6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN25C9JDP6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN25C9JDP6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN25C9JDP6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN25C9JDP6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN25C9JDP6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN25C9JDP6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN25C9JDP6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN25C9JDP6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN25C9JDP6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN25C9JDP6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN25C9JDP6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN25C9JDP6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN25C9JDP6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN25C9JDP6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN25C9JDP6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN25C9JDP6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN25C9JDP6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN25C9JDP6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN25C9JDP6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN25C9JDP6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN25C9JDP6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN25C9JDP6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN25C9JDP6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN25C9JDP6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN25C9JDP6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN25C9JDP6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN25C9JDP6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
CLDN25C9JDP6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CLDN25C9JDP6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN25C9JDP6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN25C9JDP6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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