Protein–RNA interactions for Protein: A5A3E0

POTEF, POTE ankyrin domain family member F, humanhuman

Predictions only

Length 1,075 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEFA5A3E0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
POTEFA5A3E0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
POTEFA5A3E0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
POTEFA5A3E0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
POTEFA5A3E0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
POTEFA5A3E0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
POTEFA5A3E0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
POTEFA5A3E0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
POTEFA5A3E0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
POTEFA5A3E0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
POTEFA5A3E0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
POTEFA5A3E0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
POTEFA5A3E0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
POTEFA5A3E0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
POTEFA5A3E0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
POTEFA5A3E0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
POTEFA5A3E0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
POTEFA5A3E0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
POTEFA5A3E0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
POTEFA5A3E0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
POTEFA5A3E0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
POTEFA5A3E0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
POTEFA5A3E0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
POTEFA5A3E0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
POTEFA5A3E0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
POTEFA5A3E0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
POTEFA5A3E0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
POTEFA5A3E0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
POTEFA5A3E0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
POTEFA5A3E0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
POTEFA5A3E0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
POTEFA5A3E0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
POTEFA5A3E0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
POTEFA5A3E0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
POTEFA5A3E0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
POTEFA5A3E0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
POTEFA5A3E0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
POTEFA5A3E0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
POTEFA5A3E0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
POTEFA5A3E0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
POTEFA5A3E0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
POTEFA5A3E0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
POTEFA5A3E0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
POTEFA5A3E0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
POTEFA5A3E0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
POTEFA5A3E0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
POTEFA5A3E0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
POTEFA5A3E0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
POTEFA5A3E0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
POTEFA5A3E0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
POTEFA5A3E0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
POTEFA5A3E0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
POTEFA5A3E0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
POTEFA5A3E0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
POTEFA5A3E0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
POTEFA5A3E0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
POTEFA5A3E0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
POTEFA5A3E0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
POTEFA5A3E0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
POTEFA5A3E0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
POTEFA5A3E0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
POTEFA5A3E0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
POTEFA5A3E0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
POTEFA5A3E0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
POTEFA5A3E0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
POTEFA5A3E0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
POTEFA5A3E0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
POTEFA5A3E0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
POTEFA5A3E0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
POTEFA5A3E0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
POTEFA5A3E0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
POTEFA5A3E0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
POTEFA5A3E0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
POTEFA5A3E0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
POTEFA5A3E0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
POTEFA5A3E0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
POTEFA5A3E0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
POTEFA5A3E0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
POTEFA5A3E0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
POTEFA5A3E0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
POTEFA5A3E0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
POTEFA5A3E0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
POTEFA5A3E0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
POTEFA5A3E0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
POTEFA5A3E0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
POTEFA5A3E0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
POTEFA5A3E0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
POTEFA5A3E0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
POTEFA5A3E0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
POTEFA5A3E0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
POTEFA5A3E0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
POTEFA5A3E0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
POTEFA5A3E0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
POTEFA5A3E0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
POTEFA5A3E0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
POTEFA5A3E0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
POTEFA5A3E0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
POTEFA5A3E0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
POTEFA5A3E0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
POTEFA5A3E0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms