Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms