Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms