Protein–RNA interactions for Protein: Q16568

CARTPT, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARTPTQ16568 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CARTPTQ16568 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms