Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
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