Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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SNX13Q9Y5W8 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX13Q9Y5W8 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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SNX13Q9Y5W8 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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SNX13Q9Y5W8 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX13Q9Y5W8 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX13Q9Y5W8 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX13Q9Y5W8 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX13Q9Y5W8 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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SNX13Q9Y5W8 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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SNX13Q9Y5W8 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX13Q9Y5W8 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX13Q9Y5W8 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX13Q9Y5W8 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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SNX13Q9Y5W8 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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SNX13Q9Y5W8 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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SNX13Q9Y5W8 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX13Q9Y5W8 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX13Q9Y5W8 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX13Q9Y5W8 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX13Q9Y5W8 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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SNX13Q9Y5W8 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX13Q9Y5W8 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX13Q9Y5W8 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
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