Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms