Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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