Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms