Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms