Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWX9

SELENOM, Selenoprotein M, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOMQ8WWX9 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms