Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Q1

TMCO5A, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5AQ8N6Q1 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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TMCO5AQ8N6Q1 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMCO5AQ8N6Q1 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMCO5AQ8N6Q1 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMCO5AQ8N6Q1 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMCO5AQ8N6Q1 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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TMCO5AQ8N6Q1 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMCO5AQ8N6Q1 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMCO5AQ8N6Q1 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMCO5AQ8N6Q1 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMCO5AQ8N6Q1 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMCO5AQ8N6Q1 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMCO5AQ8N6Q1 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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TMCO5AQ8N6Q1 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMCO5AQ8N6Q1 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMCO5AQ8N6Q1 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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TMCO5AQ8N6Q1 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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TMCO5AQ8N6Q1 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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TMCO5AQ8N6Q1 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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TMCO5AQ8N6Q1 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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TMCO5AQ8N6Q1 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMCO5AQ8N6Q1 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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TMCO5AQ8N6Q1 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCO5AQ8N6Q1 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCO5AQ8N6Q1 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCO5AQ8N6Q1 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCO5AQ8N6Q1 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCO5AQ8N6Q1 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCO5AQ8N6Q1 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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