Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z422

SZRD1, SUZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SZRD1Q7Z422 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SZRD1Q7Z422 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms