Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms