Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
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