Protein–RNA interactions for Protein: Q96PR1

KCNC2, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC2Q96PR1 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
KCNC2Q96PR1 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms