Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

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Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
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