Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms