Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTPAP49638 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTPAP49638 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTPAP49638 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTPAP49638 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTPAP49638 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTPAP49638 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTPAP49638 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TTPAP49638 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTPAP49638 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TTPAP49638 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTPAP49638 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTPAP49638 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTPAP49638 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TTPAP49638 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTPAP49638 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTPAP49638 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTPAP49638 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTPAP49638 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTPAP49638 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTPAP49638 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTPAP49638 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTPAP49638 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTPAP49638 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTPAP49638 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTPAP49638 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTPAP49638 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTPAP49638 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTPAP49638 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTPAP49638 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTPAP49638 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTPAP49638 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTPAP49638 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTPAP49638 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTPAP49638 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTPAP49638 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTPAP49638 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTPAP49638 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTPAP49638 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTPAP49638 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTPAP49638 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TTPAP49638 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TTPAP49638 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTPAP49638 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTPAP49638 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTPAP49638 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTPAP49638 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTPAP49638 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTPAP49638 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTPAP49638 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTPAP49638 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TTPAP49638 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTPAP49638 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTPAP49638 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTPAP49638 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTPAP49638 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTPAP49638 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTPAP49638 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTPAP49638 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTPAP49638 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTPAP49638 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTPAP49638 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTPAP49638 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTPAP49638 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTPAP49638 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTPAP49638 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTPAP49638 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTPAP49638 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTPAP49638 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTPAP49638 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTPAP49638 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTPAP49638 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTPAP49638 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TTPAP49638 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTPAP49638 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTPAP49638 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTPAP49638 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TTPAP49638 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TTPAP49638 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTPAP49638 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTPAP49638 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTPAP49638 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TTPAP49638 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTPAP49638 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTPAP49638 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTPAP49638 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTPAP49638 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTPAP49638 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTPAP49638 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTPAP49638 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTPAP49638 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTPAP49638 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTPAP49638 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTPAP49638 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTPAP49638 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTPAP49638 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTPAP49638 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
TTPAP49638 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
TTPAP49638 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TTPAP49638 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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