Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms