Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC00299Q6ZSB3 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC00299Q6ZSB3 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC00299Q6ZSB3 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC00299Q6ZSB3 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC00299Q6ZSB3 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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LINC00299Q6ZSB3 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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LINC00299Q6ZSB3 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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LINC00299Q6ZSB3 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC00299Q6ZSB3 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC00299Q6ZSB3 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC00299Q6ZSB3 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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LINC00299Q6ZSB3 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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LINC00299Q6ZSB3 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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LINC00299Q6ZSB3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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LINC00299Q6ZSB3 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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LINC00299Q6ZSB3 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC00299Q6ZSB3 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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LINC00299Q6ZSB3 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC00299Q6ZSB3 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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LINC00299Q6ZSB3 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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LINC00299Q6ZSB3 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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