Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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