Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
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