Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD53P19397 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD53P19397 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD53P19397 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD53P19397 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD53P19397 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD53P19397 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD53P19397 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD53P19397 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD53P19397 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD53P19397 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD53P19397 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD53P19397 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD53P19397 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD53P19397 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD53P19397 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CD53P19397 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD53P19397 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD53P19397 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD53P19397 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD53P19397 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD53P19397 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD53P19397 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD53P19397 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD53P19397 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD53P19397 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD53P19397 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD53P19397 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CD53P19397 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CD53P19397 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD53P19397 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD53P19397 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CD53P19397 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CD53P19397 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD53P19397 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD53P19397 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD53P19397 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD53P19397 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD53P19397 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD53P19397 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD53P19397 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD53P19397 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD53P19397 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD53P19397 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD53P19397 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD53P19397 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD53P19397 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD53P19397 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD53P19397 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD53P19397 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD53P19397 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD53P19397 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD53P19397 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD53P19397 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD53P19397 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD53P19397 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD53P19397 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD53P19397 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD53P19397 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD53P19397 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD53P19397 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD53P19397 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD53P19397 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD53P19397 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD53P19397 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CD53P19397 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD53P19397 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD53P19397 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CD53P19397 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD53P19397 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD53P19397 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD53P19397 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD53P19397 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD53P19397 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD53P19397 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD53P19397 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD53P19397 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD53P19397 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD53P19397 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD53P19397 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD53P19397 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD53P19397 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD53P19397 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD53P19397 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD53P19397 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD53P19397 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD53P19397 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD53P19397 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD53P19397 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD53P19397 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD53P19397 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD53P19397 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD53P19397 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD53P19397 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD53P19397 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD53P19397 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD53P19397 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD53P19397 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD53P19397 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD53P19397 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms