Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRMUO75648 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRMUO75648 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRMUO75648 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRMUO75648 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRMUO75648 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRMUO75648 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRMUO75648 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRMUO75648 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRMUO75648 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRMUO75648 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRMUO75648 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRMUO75648 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRMUO75648 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRMUO75648 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRMUO75648 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRMUO75648 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRMUO75648 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRMUO75648 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRMUO75648 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRMUO75648 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRMUO75648 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRMUO75648 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRMUO75648 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRMUO75648 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRMUO75648 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRMUO75648 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRMUO75648 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRMUO75648 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRMUO75648 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRMUO75648 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRMUO75648 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRMUO75648 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRMUO75648 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRMUO75648 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRMUO75648 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRMUO75648 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRMUO75648 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRMUO75648 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRMUO75648 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRMUO75648 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRMUO75648 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRMUO75648 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRMUO75648 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRMUO75648 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRMUO75648 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRMUO75648 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRMUO75648 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRMUO75648 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRMUO75648 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TRMUO75648 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRMUO75648 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRMUO75648 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRMUO75648 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRMUO75648 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRMUO75648 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRMUO75648 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRMUO75648 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRMUO75648 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRMUO75648 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRMUO75648 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRMUO75648 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRMUO75648 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRMUO75648 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRMUO75648 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRMUO75648 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRMUO75648 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRMUO75648 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRMUO75648 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRMUO75648 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRMUO75648 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRMUO75648 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRMUO75648 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRMUO75648 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRMUO75648 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRMUO75648 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRMUO75648 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRMUO75648 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRMUO75648 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRMUO75648 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRMUO75648 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRMUO75648 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRMUO75648 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRMUO75648 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRMUO75648 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRMUO75648 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRMUO75648 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRMUO75648 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRMUO75648 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRMUO75648 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRMUO75648 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRMUO75648 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRMUO75648 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRMUO75648 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRMUO75648 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRMUO75648 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRMUO75648 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRMUO75648 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRMUO75648 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRMUO75648 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms