Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms