Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms