Protein–RNA interactions for Protein: Q96D53

COQ8B, Atypical kinase COQ8B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COQ8BQ96D53 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COQ8BQ96D53 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms