Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CAV1Q03135 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CAV1Q03135 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CAV1Q03135 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CAV1Q03135 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CAV1Q03135 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CAV1Q03135 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CAV1Q03135 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CAV1Q03135 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CAV1Q03135 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CAV1Q03135 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CAV1Q03135 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAV1Q03135 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAV1Q03135 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAV1Q03135 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAV1Q03135 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAV1Q03135 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CAV1Q03135 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAV1Q03135 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAV1Q03135 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAV1Q03135 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAV1Q03135 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAV1Q03135 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAV1Q03135 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAV1Q03135 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAV1Q03135 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAV1Q03135 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAV1Q03135 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAV1Q03135 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAV1Q03135 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAV1Q03135 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAV1Q03135 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAV1Q03135 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CAV1Q03135 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAV1Q03135 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAV1Q03135 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAV1Q03135 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAV1Q03135 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAV1Q03135 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAV1Q03135 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAV1Q03135 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAV1Q03135 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAV1Q03135 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAV1Q03135 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CAV1Q03135 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAV1Q03135 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAV1Q03135 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAV1Q03135 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAV1Q03135 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAV1Q03135 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAV1Q03135 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CAV1Q03135 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAV1Q03135 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAV1Q03135 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAV1Q03135 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAV1Q03135 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAV1Q03135 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAV1Q03135 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAV1Q03135 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAV1Q03135 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAV1Q03135 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAV1Q03135 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAV1Q03135 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAV1Q03135 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAV1Q03135 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAV1Q03135 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAV1Q03135 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAV1Q03135 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAV1Q03135 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAV1Q03135 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAV1Q03135 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAV1Q03135 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAV1Q03135 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAV1Q03135 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAV1Q03135 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CAV1Q03135 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAV1Q03135 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAV1Q03135 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAV1Q03135 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAV1Q03135 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAV1Q03135 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAV1Q03135 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAV1Q03135 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAV1Q03135 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAV1Q03135 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAV1Q03135 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAV1Q03135 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAV1Q03135 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAV1Q03135 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAV1Q03135 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAV1Q03135 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CAV1Q03135 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAV1Q03135 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CAV1Q03135 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAV1Q03135 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAV1Q03135 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAV1Q03135 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAV1Q03135 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAV1Q03135 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms